Fysiotherapie richt zich op klachten van het bewegingsapparaat met focus op spieren, banden, gewrichten en pezen. De dierfysiotherapeut behandelt de patiënt symptomatisch na verwijzing van een dierenarts, bijvoorbeeld als onderdeel van een revalidatietraject na een operatie, of herstel na een blessure. Een behandeling kan bestaan uit oefentherapie, massagetherapie en fysische therapieën (zoals elektrotherapie, lasertherapie) met als doel het verminderen van stijfheid, het vergroten van de spierkracht, verbeteren van de coördinatie en mobiliteit, het verminderen van spierspanning en zwelling en het verbeteren van de weefselcirculatie.
Vanuit AOMD oogpunt is fysiotherapie een goede aanvullende therapie na AOMD behandeling en indien geïndiceerd.